Comunidade de desenvolvedores de software de bioinformática (CDSB): a história de um hotspot de diversidade e alcance no México que espera capacitar desenvolvedores locais de R

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Por Leonardo Collado Torres, Ph. D., Pesquisador do Instituto Lieber para o Desenvolvimento do Cérebro, codificador de #rstats de genômica cerebral que trabalha com @andrewejaffe @LieberInstitute. @lcgunam @jhubiostat @jtleek alunos. @LIBDrstats @CDSBMexico co-fundador

Frequento as conferências R desde 2008 e, embora tenha visto a comunidade R crescer rapidamente, geralmente não encontro tantos latino-americanos (LatAm) entre as comunidades de desenvolvedores de R. Tradicionalmente, um investigador líder de laboratório investido em R ou biocondutor ensinava essas habilidades a seus estagiários e estudantes, tornando-se um hotspot R local. No entanto, esse cenário é incomum no México por vários motivos. Reconhecendo alguns desses desafios e motivados a promover o R ​​em nosso país e na América Latina, em 2017, Alejandro Reyes e eu nos unimos a Alejandra Medina Rivera e Heladia Salgado para lançar o CDSB da Comunidade de Desenvolvedores de Software de Bioinformática (em espanhol) em 2018. Nosso objetivo é facilitar e incentivar a transição do usuário R para o desenvolvedor de R / Biocondutor. Organizamos workshops anuais de uma semana com o NNB-UNAM e o RMB e acabamos de anunciar nosso workshop para 2020 (de 3 a 7 de agosto de 2020 em Cuernavaca, México).

Agora, no terceiro workshop, sinto que tivemos várias histórias de sucesso.

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Nós nos beneficiamos muito do apoio logístico e organizacional das equipes locais do NNB-UNAM e RMB, permitindo-nos focar na elaboração do currículo do workshop e convidando um conjunto diversificado de instrutores, incluindo Maria Teresa Ortiz, que é uma RLadiesCDMX co-fundador e tem nos apoiado desde o início. No entanto, enfrentamos desafios econômicos porque o orçamento da Fundação Nacional de Ciência (CONACyT) diminuiu nos últimos anos. O apoio do pequeno fundo da conferência R pelo R Consortium e de outros patrocinadores tem sido fundamental, assim como bolsas de estudo e diversidade que alguns de nossos instrutores conseguiram nas conferências R. Recentemente, reformulamos nossa página de patrocinador e respondemos à pergunta: por que você deveria nos apoiar?

No entanto, enquanto estamos apenas começando, um de nossos destaques nasceu do exercício de quebra-gelo da rOpenSci no CDSB2019. Conseguimos realmente criar um senso de comunidade e desejar realizar atividades de divulgação em nossas comunidades locais. Particularmente, Joselyn Chávez, um CDSB2018 e 19 ex-alunos, se ofereceu para ingressar no conselho do CDSB. No CDSB2019, também criamos um canal #rladies em nosso Slack, onde na época tínhamos membros dos 3/4 capítulos de RLadies do México (Qro, Xalapa, CDMX) e agora tem 5/6 (Cuerna, Monterrey), como ex-alunos do CDSB2018 e CDSB2019 foram co-fundadores de dois capítulos: Ana Beatriz Villaseñor-Altamirano, para Qro, e Joselyn Chávez, para Cuerna.

Estou orgulhoso e empolgado com o que alcançamos com nossos workshops CDSB de uma semana, mas também com o modo como usamos as ferramentas que aprendemos de outras comunidades para continuar interagindo e nos comunicando durante o resto do ano. O tempo dirá se nossos esforços criaram uma onda que se transformou em uma onda ou se acabaremos queimando. A sustentabilidade é um desafio, mas estamos muito motivados pelo impacto que tivemos e só podemos imaginar um futuro melhor.

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