Ferramenta COVID-19 Data Explorer do Canadá

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Nos tempos de pandemia, a comunidade de dados pode ajudar de várias maneiras, inclusive através do desenvolvimento de instrumentos para rastrear e decompor os dados sobre a disseminação da temida doença de coronavírus.

o O aplicativo COVID-19 Canada Data Explorer foi construído com R, incluindo Brilhante e Folheto, para processar o conjunto de dados oficial disponível no governo do Canadá. Eles têm sua própria ferramenta de visualização de dados, mas é muito básica. Você pode fazer muito mais com os dados disponíveis!

Portanto, sem mais delongas, basta clicar na imagem abaixo e ela será direcionada para o painel.

Espero que meu aplicativo ajude os profissionais de saúde pública, os formuladores de políticas e qualquer pessoa a se manter informado sobre o curso da epidemia de SARS-CoV-2 no Canadá. Estou planejando continuar melhorando a funcionalidade do aplicativo ao longo do tempo, possivelmente adicionando uma análise mais detalhada por províncias (se eu encontrar os dados) e / ou algumas opções básicas de modelagem estatística. Como o aplicativo está em desenvolvimento ativo, publicarei o código-fonte um pouco mais tarde – assim que me aproximar da versão final do aplicativo.

Algumas coisas a ter em mente (Coisas técnicas aqui)

O aplicativo é executado em uma versão gratuita do Shiny Server, que não permite veicular aplicativos Shiny usando criptografia SSL / TLS. Portanto, conexão HTTP em vez de HTTPS – seu navegador pode dizer que “a conexão não é segura”. Estou ciente de que pode haver uma maneira de forçar a conexão através de HTTPS usando proxy reverso, mas não consegui descobrir isso. Se você sabe como fazer isso no Apache (não no Nginx), agradeceríamos muito seu conselho (use este formulário de contato para entrar em contato comigo ou apenas comentar na publicação).

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Os dados são baixados do Canada.ca em intervalos de 2 horas, desde que tenham registros de data e hora mais recentes. Isso significa que pode haver um atraso de até duas horas a partir do momento em que o Canada.ca atualiza seus dados até o momento em que são atualizados no meu servidor.

Se os dados do indicador escolhido (provavelmente “novos casos”) não estiverem disponíveis para a data selecionada, uma mensagem de erro piscará brevemente e a data voltará ao último dia para o qual os dados estão disponíveis para esse indicador .

O indicador “Casos por 100.000” mostra a prevalência geral por 100.000 habitantes ao longo do tempo de pandemia, não o número de pessoas que estão doentes no momento (isto é, sem levar em conta as pessoas que se recuperaram).

O indicador “Testes realizados por 1.000” mostra exatamente o que diz – o número de testes por 1.000 pessoas, não a porcentagem ou a parcela de pessoas testadas. Lembre-se de que uma pessoa pode ser testada várias vezes.

“Taxa de mortalidade de casos” é um percentual daqueles que morreram entre os diagnosticado casos, não de todos que podem ter sido infectados ou doentes (o número que simplesmente não sabemos até o momento). De fato, com base nos primeiros resultados do teste de anticorpos da população em geral [1, 2], parece provável que as taxas de infecção sejam muito mais altas e as taxas de mortalidade de casos sejam muito mais baixas do que se pensa atualmente. No entanto, testes sorológicos randomizados em larga escala serão necessários para determinar as taxas reais de mortalidade. Observe também que a taxa de mortalidade de casos não deve ser confundida com a taxa de mortalidade.

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A publicação COVID-19 Canada Data Explorer Tool apareceu pela primeira vez no Blog do Data Enthusiast.



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