Package lconnect: métricas de conectividade e priorização de patches

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Hoje estou revisitando uma postagem de blog mais antiga em nosso pacote lconnect, disponível no CRAN (aqui). Se você quiser aprender sobre o métricas de conectividade disponíveis verifique este post.

Pretende-se ser uma abordagem muito simples para derivar métricas de conectividade de paisagem. Muitas dessas métricas vêm da interpretação da paisagem como gráficos.

Além disso, também fornece uma função para priorizar manchas de paisagem com base em sua contribuição para a conectividade geral da paisagem. Por enquanto, esta função funciona apenas com o Índice integral de conectividade, de Pascual-Hortal e Saura (2006).

Aqui está um breve tutorial!

Primeiro instalar o pacote:

#load package from CRAN
#install.packages("lconnect")
library(devtools)

Então, faça upload do shapefile da paisagem

#Load data
vec_path 

… E crie um ‘objeto de classe lconnect ‘:

#upload landscape
land 
## [1] "lconnect"

E agora, vamos enredo isto:

plot(land, main="Landscape clusters")

fig1

Se quisermos, podemos derivar importância do patch (a contribuição de cada patch individual para a conectividade geral):

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land1 
##  [1]  0.0000000  0.0000000  0.0000000  0.0000000  0.0000000  0.1039501
##  [7]  0.1039501  0.0000000  0.1039501  0.0000000  0.0000000  0.1039501
## [13]  0.3118503 21.9334719  0.0000000 15.5925156  2.5987526  0.1039501
## [19]  0.1039501  0.2079002  0.0000000  0.0000000  0.0000000  0.0000000
## [25]  0.9355509  0.0000000 14.2411642  2.9106029  0.2079002 12.9937630
## [31]  0.3118503  0.7276507  0.0000000  7.5883576  0.5197505 70.2702703
class(land1)

O que produz um objeto da classe ‘cafetão’:

## [1] "pimp"

E, finalmente, também podemos traçar o contribuição relativa de cada patch à conectividade paisagem:

plot(land1, main="Patch prioritization (%)")

fig2

E é isso!



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